1954 m. Baltojoje Vokėje atidaryta nauja mokykla, pavadinta Rūdninkų septynmete. Joje buvo dėstoma rusų ir lietuvių kalbomis. Mokykloje įrengti fizikos ir chemijos kabinetai, gamtos reiškinių stebėjimo aikštelė, dirbtuvės.
1954 – 1955 m. Rūdninkų septynmetėje mokykloje mokėsi 179 mokiniai. Buvo 10 klasių komplektų. Veikė vakarinė darbo jaunimo mokykla. Joje mokėsi 34 mokiniai.
1964 m. prie Baltosios Vokės vidurinės mokyklos buvo prijungta Papiškių septynmetė mokykla (dėstoma lenkų kalba).
Iki 1992 m. Baltosios Vokės vidurinėje mokykloje buvo dėstoma lenkų, rusų ir lietuvių kalbomis.
1992 m. atidaryta atskira lietuviška mokykla. Ji įsikūrė senajame mokyklos pastate. Lietuviškoje mokykloje dirbo 18 mokytojų, mokėsi 134 mokiniai. Pirmasis lietuviškosios mokyklos direktorius buvo Gintautas Pakalnis.
2015 m. liepos 29 d. mokykla tapo gimnazija.
2019-07-02